а) структура Главного управления
В первое время, до декабря 1941 г., в бытность полковника Соодла заместителем директора внутренних дел Эстонского самоуправления, «Омакайтсе» входило в состав директории внутренних дел и последней был создан крупный аппарат: Главное управление полиции и «Омакайтсе», состоявший из нескольких инспектур и штаба. В штаб входило 6 отделов: оперативный; интендантский; кадровый; «Омакайтсе»; полиции; пожарный.
Полки «Омакайтсе» были подчинены в одинаковой мере полковнику Соодла и немецким комендантам.
В середине декабря 1941 г. полки «Омакайтсе» вышли из оперативного подчинения Главному управлению полиции «Омакайтсе» и были переданы немецким полевым комендатурам.
Политическая и сыскная полиция из Главного управления полиции «Омакайтсе» была передана в непосредственное подчинение немецкому Гестапо.
Осенью 1942 г. Главное управление полиции «Омакайтсе» было разделено на два самостоятельных главных управления: Главное управление полиции и Главное управление «Омакайтсе». С указанного периода до 22 сентября 1944 г. Главное управление «Омакайтсе» имело следующую структуру:
начальник Главного управления «Омакайтсе» полковник Синка руководил «Омакайтсе» по указаниям немецкого военного командования (начальника тыла на территории Эстонии генерала Ботх и командира Нарвской армейской группы, которым подчинялись комендатуры, использующие полки «Омакайтсе»), представлял немецкому военному командованию на утверждение офицеров в полках, руководил работой по пополнению полков личным составом, вооружением полков, обучением и военным воспитанием членов «Омакайтсе», представлял на утверждение директоров внутренних дел эстонского самоуправления и все назначения должностных лиц в Главном управлении.
Главное управление «Омакайтсе» состояло из нижеследующих четырех отделов: Первый отдел (оперативный), начальник отдела — зам. нач. Главного управления полковник Майде, заместители: майор Тамм и капитан Кийдла.
В задачи отдела входило руководство вопросами оперативно-учебного характера.
Отдел состоял из 4-х отделений.
1 отделение (оперативное), начальник отделения и зам. нач. отдела капитан Киидла, зам. нач. отделения лейтенант Хенносте (позже — начальник отделения лейтенант Хенносте, зам. нач. ст. лейтенант Роземанус). Офицер связи при немецкой дивизии в городе Тарту капитан Яксон (позже капитан Кругвель).
2 отделение (учебно-воспитательное), начальник отделения капитан Хинт.
3 отделение (учетное), начальник отделения капитан Кийдла, зам. нач. лейтенант Вески (с мая 1944 г. начальник отделения майор Тулнола, зам. нач. Нурмисту).
4 отделение (канцелярия и секретная переписка), начальник отделения капитан Виттинг.
Второй отдел (снабжения), начальник отдела подполковник Хинно.
1 отделение (денежного учета), начальник отделения Пиэвере.
2 отделение (вещевого и продовольственного снабжения), начальник отделения капитан Пэрк, зам. нач. отделения капитан Рандмера.
3 отделение (вооружения), начальник отделения Клемени. Второй отдел имел оружейную, сапожную и портняжную мастерские.
Третий отдел (кадровый и общая переписка), начальник отдела подполковник Кальберг.
1 отделение (учет командного состава и ведение личных дел до взводных командиров включительно), начальник отделения лейтенант Утсал, позже лейтенант Аукси и лейтенант Наэль, зам. нач. отделения Гентален.
2 отделение (канцелярия и секретная переписка), начальник отделения майор Кескюль.
3 отделение (юридическое), начальник отделения подполковник Егевеу.
4 отделение (историко-архивное), начальник отделения майор Тулнола (до мая 1944 г.).
5 отделение (библиотека), начальник отделения подполковник Лиивола. Четвертый отдел («Найскодукайтсе» — женская самозащита), начальник отдела Юхани.